中央空调的水系统和氟系统都有各自的特点和优势，适用于不同的场景和需求。在选择中央空调系统时，需要综合考虑多个因素，包括建筑结构、使用需求、预算等。以下是水系统和氟系统的部分区别：
- 工作原理：氟系统中央空调与水系统中央空调的原理都是通过压缩机做功将室内的热量与室外的热量进行交换，从而达到室内温度的调节。二者之间主要的区别就是使用的热量传输冷媒不同，氟系统使用氟利昂作为冷媒，水系统使用水作为冷媒。
- 安装特点：氟系统中央空调通过压缩机做功，将铜管中的冷媒压缩，从而实现氟利昂的流量分配，铜管的管径也从主机位置到风机盘管位置越变越细，配管最长可以达到 120 米，单管可以做到 40 米，室内外机的高差可以达到 50 米。水系统中央空调主机内部就有热量转化到水中的板换器装置，在主机的外部使用的管道可以是镀锌钢管、ppr 管、铝塑管，目前使用在家用的管道都是 ppr 管居多留下的接头也比较多，但也有安装公司使用铝塑管作为室内安装管道，在室内能够一根管到底，中间无接头。
- 舒适度：氟系统中央空调使用的冷媒氟利昂蒸发温度远低于水温，在室内风机盘管出风的温差会比较大，室内的空气更加干燥，人体对温度的温差越大适应能力越弱，人体受到的影响越大，舒适性也就越差，氟空调的室内机出风温度在 7-10 度左右，而室内的温度设定一般在 20-26 度之间，有着 10 多度的温差。水系统空调使用的冷媒为水，空调换热之后产生的冷冻水在 12-15 度之间，与室内的环境温度相差较小，只有 7-8 度的温差，冷媒自身为水，不会影响室内的湿度，因此不会感到干燥，对于风机盘管而言，低温差，大风量，出风柔和，更加适合人体的舒适度体验。
- 控制方面：氟系统空调的室内机与室外机必须批次一一对应，需要极强的信号通讯控制，单台室内机出现故障，整套空调系统都会瘫痪，每天室外机对应室内机的数量也有限制，最多分为 16 台室内机，受到配线长度的限制。一旦维修一台空调，整套空调系统都要停运，还得放掉氟利昂，维修完毕后重新添加冷媒，并且氟系统空调受到升级换代的限制，室内外机无法通用，只要停产之后，很难匹配到相应的室内外机，只能报废换新。水系统空调的室外机和室内机属于独立的系统，采用信号线进行联动，室内外机不受到管道长度的影响，与水泵功率有关，每天室内机都有独立的水流控制阀门，倘若一台室内机出现故障，可以独立进行维修，其他空调还能正常运转，室内机之间互不影响。关键是水系统空调具有通用性，任意品牌的室内外机都能进行功率匹配，就算是空调在技术上更新了，室内外机也能正常的进行换代升级。
- 成本方面：对于小型中央空调而言，氟系统的价格更具有优势，但是大型的中央空调，水系统空调造价远低于氟系统，因为水系统中央空调的室外机价格比较贵，但是室内机价格很便宜，户型越大使用的室内机数量越多，此外水系统空调在材料上和冷媒上的投入都要低于氟系统的铜管安装和氟利昂投入。在使用费用上，在水系统中央空调没有投入变频技术之前，变频氟系统空调的能耗要低于水系统，而现在水系统空调在变频技术和喷气增焓技术的投入，水系统空调的能耗与氟系统空调不相上下，在制冷时水系统空调更舒适，在制热时苏锡通空调更耐低温，能耗更低。
综上所述，水系统中央空调适合对舒适度要求较高、需要长时间运行的场所，例如酒店、医院、大型商场等。而氟系统中央空调则适合对安装空间有限制、对空调效率要求较高的场所，例如小型办公室、家庭等。
