巴氏除菌是一种利用较低温度进行消毒的方法。在洗衣机中，巴氏除菌功能通常是将水加热到 60℃左右，并保持一段时间（一般为 30 分钟），以达到杀灭细菌的目的。
这种方法的主要原理是，一般细菌的致死点在温度 68℃与时间 30min 以下，通过将水温控制在 60℃左右并维持一定时间，可以杀灭大部分的致病性细菌和绝大多数非致病性细菌。同时，由于温度相对较低，对衣物纤维的损伤较小，能在一定程度上保持衣物的质地和柔软度。
巴氏除菌法由法国微生物学家巴斯德发明，原是一种用于食品加工的低温杀菌法，可在杀死病菌的同时保持食品中营养物质风味不变。现在广义地用于定义需要杀死各种病原菌的热处理方法。
不过，并非所有衣物都适合巴氏除菌洗，一些不耐高温的衣物材质，如部分化纤和丝绸类衣物，可能无法承受这种洗涤方式。在使用洗衣机的巴氏除菌功能时，建议参考衣物的洗涤标签，以确定是否适合该模式。
此外，除了巴氏除菌，目前市面上常见的洗衣机除菌方式还有高温除菌、紫外线除菌、臭氧除菌、银离子除菌等，它们各有特点，可以根据实际需求进行选择。例如，高温除菌是将水加热到 90°C 左右来灭活细菌，但可能对衣物损伤较大且耗电量较高；紫外线除菌通过破坏细菌的细胞膜、DNA 等使其死亡或失去繁殖能力，相对安全且对衣物损伤小，但灭菌时间较长；银离子除菌则是利用银离子与细胞蛋白质结合使其失去活性，适用范围较广且对衣物损伤小，但使用久了除菌效果可能会降低。